A partir de una amplia gama de patógenos disponibles en el Instituto de Microbiología e Infección de la Universidad de Birmingham primero identificaremos aquellos que inducen la inclusión de un rango estrecho de exons en las tres regiones variables, ya que son indicativos de alta afinidad Interacciones. Para este análisis desarrollamos herramientas de Biología Molecular altamente eficientes, incluyendo secuenciación de alto rendimiento para análisis eficientes [4].
Una vez que hayamos obtenido una opción más amplia de patógenos identificaremos las moléculas bacterianas que afectan al empalme alternativo Dscam y determinaremos si se unen a Dscam utilizando enfoques genéticos, moleculares y bioquímicos.
Se cree que el empalme alternativo proporciona un mecanismo importante para la adaptación de la función celular a los entornos cambiantes, por ejemplo, durante la infección. El patrón de empalme Dscam se establece inicialmente en una proporción predefinida, pero probabísticamente a nivel celular [4, 5]. Estableceremos un reportero de empalme alternativo Dscam basado en GFP para identificar las vías, cómo los patógenos conducen a cambios adaptativos en el empalme alternativo durante una respuesta inmunitaria innata.
Fecha cierre convocatoria beca 31 enero 2020
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