Aplicaciones para una Beca doctoral Durham financiada por la competencia en el grupo del Dr. Martin Schröder (Departamento de bioCiencias) para caracterizar bioquímicamente la producción del retículo endoplasmático (ER) señal de estrés por la actividad endorribonucleasa de Ire1 están invitados.
Ire1 es una proteína quinasa bifuncional endorribonucleasa que se activa en el estrés de ER causada por la acumulación de proteínas desdobladas o mal plegadas en la ER. Ire1 protege las células eucariotas de las consecuencias tóxicas de los niveles elevados de proteínas desdobladas iniciando el procesamiento del mRNA para el factor de transcripción bZIP HAC1/XBP1. La hendidura del HAC1 mRNA en dos ensambladuras del exón-intrón por Ire1 seguida por la ligadura de los dos exones HAC1 por la ligasa del tRNA quita un atenuador traslacional del HAC1 mRNA y aumenta la potencia del dominio transcripcional de la activación de HAC1.
El candidato exitoso investigará cómo la acumulación de proteínas desplegadas en el ER activa el dominio endorribonucleasa de Ire1. Para resolver esta pregunta el candidato acertado (1) caracteriza el atascamiento de los nucleótidos de la adenina al tipo salvaje Ire1 y a varios mutantes Ire1, y (2) caracteriza los efectos del atascamiento del nucleótido en actividad enzimática y la conformación del dominio endorribonucleasa. El proyecto hará uso de una variedad de técnicas bioquímicas y genéticas moleculares, tales como la construcción y caracterización de la actividad de los mutantes Ire1 in vivo, expresión y purificación de Ire1 en Escherichia coli, cinética enzimática, Unión de nucleótidos ensayos y estudios espectroscópicos de fluorescencia con estas proteínas purificadas.
Fecha cierre convocatoria beca 11 enero 2019
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