En los eucariotas, el ADN genómico se envuelve alrededor de las histonas, dando lugar a cromatina. Las histonas se modifican después de la traducción por la adición de varios grupos químicos. Estas modificaciones se correlacionan con la ducoromatina activa y la heterocroromatina silenciosa. En el nematodo C. elegans, la heterocrocina se define por dos tipos de marcas de histona, la histona metilada 3 lisina 27 y la lisina 9 (H3K9). Hasta la fecha, los gusanos han sido fundamentales en la definición de la interacción entre la metilación H3K9, la localización subnuclear y la represión transcripcional de elementos repetitivos. Además, estudios anteriores demostraron una función para el H3K9 metilado en la estabilización del destino celular. La correlación entre el silenciamiento transcripcional y la presencia de la marca se ha establecido claramente, sin embargo, el contenido proteico de la cromatina asociada con H3K9me3 y la importancia de estas proteínas para la represión génica sigue siendo en gran medida desconocido. Este proyecto tiene como objetivo la caracterización funcional imparcial de las proteínas asociadas a H3K9me3 en C. elegans antes de extenderlo a otras marcas histonas.
Como parte de una colaboración continua entre el laboratorio Meister de la Universidad de Berna y el laboratorio Baubec de la Universidad de Zúrich, hemos desarrollado sondas codificadas genéticamente específicas para la histona trimetilada 3 lisina 9 que pueden ser estables expresados en nematodos intactos. Proponemos utilizar estas sondas para definir qué proteínas se asocian con la heterocrocrotina H3K9me3 en animales de tipo salvaje por espectrometría de masas. El papel de estas proteínas en la regulación de la función de la heterocromatina será validado funcionalmente, arrojando luz sobre el mecanismo molecular por el cual la marca de histona dirige la represión transcripcional durante el desarrollo. Al extender nuestra investigación a cepas mutantes para factores de cromatina H3K9 previamente caracterizados, exploraremos su papel en la regulación de la composición y función de la heterocromatina. Técnicamente, los dos laboratorios tienen una amplia experiencia en métodos genéticos y genómicos de Células de C. elegans y mamíferos, enfoques avanzados de microscopía y espectrometría de masas de cromatina.
Fecha cierre convocatoria beca 1 marzo 2020
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