EPFL ofrece un número limitado de becas a nivel de maestría a estudiantes con registros académicos sobresalientes. Algunas de las becas son financiadas por EPFL directamente y otras a través de asociaciones con fundaciones o empresas.
Cualquier persona que solicite un programa de maestría de EPFL es elegible. La selección de los candidatos y la concesión de las becas se realiza basándose únicamente en la evaluación de los expedientes académicos de los candidatos.